Protein–RNA interactions for Protein: Q02111

Prkcq, Protein kinase C theta type, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcqQ02111 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PrkcqQ02111 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PrkcqQ02111 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PrkcqQ02111 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PrkcqQ02111 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PrkcqQ02111 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PrkcqQ02111 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PrkcqQ02111 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PrkcqQ02111 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PrkcqQ02111 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PrkcqQ02111 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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PrkcqQ02111 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PrkcqQ02111 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PrkcqQ02111 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PrkcqQ02111 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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PrkcqQ02111 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PrkcqQ02111 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PrkcqQ02111 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PrkcqQ02111 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PrkcqQ02111 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PrkcqQ02111 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PrkcqQ02111 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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PrkcqQ02111 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PrkcqQ02111 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PrkcqQ02111 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PrkcqQ02111 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PrkcqQ02111 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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PrkcqQ02111 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PrkcqQ02111 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PrkcqQ02111 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PrkcqQ02111 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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PrkcqQ02111 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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PrkcqQ02111 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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PrkcqQ02111 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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PrkcqQ02111 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PrkcqQ02111 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PrkcqQ02111 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PrkcqQ02111 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PrkcqQ02111 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PrkcqQ02111 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PrkcqQ02111 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PrkcqQ02111 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PrkcqQ02111 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PrkcqQ02111 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PrkcqQ02111 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PrkcqQ02111 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PrkcqQ02111 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PrkcqQ02111 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PrkcqQ02111 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PrkcqQ02111 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrkcqQ02111 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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PrkcqQ02111 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrkcqQ02111 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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PrkcqQ02111 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrkcqQ02111 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrkcqQ02111 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrkcqQ02111 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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PrkcqQ02111 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrkcqQ02111 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrkcqQ02111 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrkcqQ02111 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrkcqQ02111 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrkcqQ02111 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrkcqQ02111 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrkcqQ02111 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrkcqQ02111 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrkcqQ02111 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PrkcqQ02111 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PrkcqQ02111 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PrkcqQ02111 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PrkcqQ02111 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PrkcqQ02111 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PrkcqQ02111 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PrkcqQ02111 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PrkcqQ02111 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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