Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
EgfrQ01279 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EgfrQ01279 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EgfrQ01279 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EgfrQ01279 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EgfrQ01279 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EgfrQ01279 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EgfrQ01279 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EgfrQ01279 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EgfrQ01279 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
EgfrQ01279 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EgfrQ01279 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EgfrQ01279 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EgfrQ01279 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
EgfrQ01279 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EgfrQ01279 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EgfrQ01279 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EgfrQ01279 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EgfrQ01279 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EgfrQ01279 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EgfrQ01279 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EgfrQ01279 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EgfrQ01279 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
EgfrQ01279 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EgfrQ01279 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
EgfrQ01279 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EgfrQ01279 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EgfrQ01279 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EgfrQ01279 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EgfrQ01279 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EgfrQ01279 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EgfrQ01279 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EgfrQ01279 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EgfrQ01279 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EgfrQ01279 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EgfrQ01279 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EgfrQ01279 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EgfrQ01279 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EgfrQ01279 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EgfrQ01279 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EgfrQ01279 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EgfrQ01279 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EgfrQ01279 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EgfrQ01279 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EgfrQ01279 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EgfrQ01279 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EgfrQ01279 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EgfrQ01279 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EgfrQ01279 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
EgfrQ01279 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EgfrQ01279 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
EgfrQ01279 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EgfrQ01279 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EgfrQ01279 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EgfrQ01279 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
EgfrQ01279 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EgfrQ01279 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EgfrQ01279 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EgfrQ01279 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EgfrQ01279 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EgfrQ01279 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EgfrQ01279 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EgfrQ01279 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EgfrQ01279 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EgfrQ01279 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EgfrQ01279 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EgfrQ01279 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EgfrQ01279 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EgfrQ01279 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EgfrQ01279 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
EgfrQ01279 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EgfrQ01279 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
EgfrQ01279 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EgfrQ01279 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
EgfrQ01279 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
EgfrQ01279 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
EgfrQ01279 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
EgfrQ01279 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
EgfrQ01279 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EgfrQ01279 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
EgfrQ01279 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EgfrQ01279 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EgfrQ01279 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
EgfrQ01279 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EgfrQ01279 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
EgfrQ01279 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EgfrQ01279 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EgfrQ01279 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EgfrQ01279 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EgfrQ01279 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
EgfrQ01279 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EgfrQ01279 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EgfrQ01279 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EgfrQ01279 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EgfrQ01279 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
EgfrQ01279 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
EgfrQ01279 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
EgfrQ01279 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
EgfrQ01279 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
EgfrQ01279 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms