Protein–RNA interactions for Protein: Q01098

Grin2c, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2cQ01098 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Grin2cQ01098 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Grin2cQ01098 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Grin2cQ01098 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Grin2cQ01098 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Grin2cQ01098 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Grin2cQ01098 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Grin2cQ01098 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Grin2cQ01098 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Grin2cQ01098 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Grin2cQ01098 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Grin2cQ01098 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Grin2cQ01098 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Grin2cQ01098 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Grin2cQ01098 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Grin2cQ01098 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Grin2cQ01098 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Grin2cQ01098 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Grin2cQ01098 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Grin2cQ01098 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Grin2cQ01098 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Grin2cQ01098 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Grin2cQ01098 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Grin2cQ01098 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Grin2cQ01098 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Grin2cQ01098 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Grin2cQ01098 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Grin2cQ01098 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Grin2cQ01098 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Grin2cQ01098 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Grin2cQ01098 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Grin2cQ01098 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Grin2cQ01098 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Grin2cQ01098 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Grin2cQ01098 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Grin2cQ01098 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Grin2cQ01098 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Grin2cQ01098 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Grin2cQ01098 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Grin2cQ01098 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Grin2cQ01098 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Grin2cQ01098 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Grin2cQ01098 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Grin2cQ01098 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Grin2cQ01098 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Grin2cQ01098 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Grin2cQ01098 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Grin2cQ01098 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Grin2cQ01098 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Grin2cQ01098 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Grin2cQ01098 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Grin2cQ01098 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Grin2cQ01098 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Grin2cQ01098 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Grin2cQ01098 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Grin2cQ01098 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Grin2cQ01098 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Grin2cQ01098 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Grin2cQ01098 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms