Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Grin2bQ01097 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Grin2bQ01097 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Grin2bQ01097 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Grin2bQ01097 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Grin2bQ01097 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Grin2bQ01097 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Grin2bQ01097 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Grin2bQ01097 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Grin2bQ01097 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Grin2bQ01097 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Grin2bQ01097 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Grin2bQ01097 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Grin2bQ01097 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Grin2bQ01097 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Grin2bQ01097 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Grin2bQ01097 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Grin2bQ01097 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Grin2bQ01097 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Grin2bQ01097 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Grin2bQ01097 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Grin2bQ01097 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Grin2bQ01097 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Grin2bQ01097 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Grin2bQ01097 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Grin2bQ01097 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Grin2bQ01097 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Grin2bQ01097 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Grin2bQ01097 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Grin2bQ01097 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Grin2bQ01097 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Grin2bQ01097 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Grin2bQ01097 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Grin2bQ01097 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Grin2bQ01097 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Grin2bQ01097 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Grin2bQ01097 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Grin2bQ01097 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Grin2bQ01097 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Grin2bQ01097 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Grin2bQ01097 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Grin2bQ01097 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Grin2bQ01097 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Grin2bQ01097 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Grin2bQ01097 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Grin2bQ01097 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Grin2bQ01097 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Grin2bQ01097 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Grin2bQ01097 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Grin2bQ01097 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Grin2bQ01097 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Grin2bQ01097 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Grin2bQ01097 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Grin2bQ01097 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Grin2bQ01097 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Grin2bQ01097 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Grin2bQ01097 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Grin2bQ01097 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Grin2bQ01097 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Grin2bQ01097 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Grin2bQ01097 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Grin2bQ01097 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Grin2bQ01097 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Grin2bQ01097 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Grin2bQ01097 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Grin2bQ01097 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Grin2bQ01097 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Grin2bQ01097 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Grin2bQ01097 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Grin2bQ01097 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Grin2bQ01097 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Grin2bQ01097 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Grin2bQ01097 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Grin2bQ01097 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Grin2bQ01097 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Grin2bQ01097 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Grin2bQ01097 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Grin2bQ01097 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Grin2bQ01097 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Grin2bQ01097 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Grin2bQ01097 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Grin2bQ01097 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Grin2bQ01097 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Grin2bQ01097 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Grin2bQ01097 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Grin2bQ01097 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Grin2bQ01097 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Grin2bQ01097 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Grin2bQ01097 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Grin2bQ01097 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Grin2bQ01097 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Grin2bQ01097 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Grin2bQ01097 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Grin2bQ01097 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Grin2bQ01097 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Grin2bQ01097 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Grin2bQ01097 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Grin2bQ01097 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Grin2bQ01097 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Grin2bQ01097 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms