Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms