Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms