Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms