Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SeleQ00690 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
SeleQ00690 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SeleQ00690 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SeleQ00690 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SeleQ00690 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SeleQ00690 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms