Protein–RNA interactions for Protein: P97474

Pitx2, Pituitary homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx2P97474 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pitx2P97474 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pitx2P97474 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pitx2P97474 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pitx2P97474 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pitx2P97474 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pitx2P97474 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pitx2P97474 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pitx2P97474 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pitx2P97474 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pitx2P97474 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Pitx2P97474 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pitx2P97474 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pitx2P97474 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pitx2P97474 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Pitx2P97474 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pitx2P97474 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pitx2P97474 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pitx2P97474 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pitx2P97474 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pitx2P97474 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pitx2P97474 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pitx2P97474 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pitx2P97474 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pitx2P97474 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pitx2P97474 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pitx2P97474 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pitx2P97474 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pitx2P97474 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pitx2P97474 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pitx2P97474 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pitx2P97474 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pitx2P97474 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pitx2P97474 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pitx2P97474 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pitx2P97474 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pitx2P97474 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pitx2P97474 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pitx2P97474 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pitx2P97474 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pitx2P97474 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pitx2P97474 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Pitx2P97474 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pitx2P97474 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pitx2P97474 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pitx2P97474 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pitx2P97474 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pitx2P97474 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pitx2P97474 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pitx2P97474 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pitx2P97474 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pitx2P97474 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pitx2P97474 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pitx2P97474 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pitx2P97474 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pitx2P97474 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pitx2P97474 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pitx2P97474 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Pitx2P97474 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pitx2P97474 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pitx2P97474 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pitx2P97474 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pitx2P97474 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pitx2P97474 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pitx2P97474 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pitx2P97474 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pitx2P97474 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pitx2P97474 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms