Protein–RNA interactions for Protein: P97371

Psme1, Proteasome activator complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme1P97371 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Psme1P97371 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Psme1P97371 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Psme1P97371 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Psme1P97371 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Psme1P97371 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Psme1P97371 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Psme1P97371 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Psme1P97371 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Psme1P97371 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Psme1P97371 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Psme1P97371 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Psme1P97371 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Psme1P97371 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Psme1P97371 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Psme1P97371 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Psme1P97371 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Psme1P97371 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Psme1P97371 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Psme1P97371 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Psme1P97371 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Psme1P97371 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Psme1P97371 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Psme1P97371 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Psme1P97371 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Psme1P97371 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Psme1P97371 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Psme1P97371 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Psme1P97371 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Psme1P97371 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Psme1P97371 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Psme1P97371 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Psme1P97371 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Psme1P97371 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Psme1P97371 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Psme1P97371 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Psme1P97371 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Psme1P97371 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Psme1P97371 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Psme1P97371 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Psme1P97371 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Psme1P97371 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Psme1P97371 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Psme1P97371 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Psme1P97371 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Psme1P97371 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Psme1P97371 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Psme1P97371 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Psme1P97371 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Psme1P97371 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Psme1P97371 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Psme1P97371 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Psme1P97371 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Psme1P97371 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Psme1P97371 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Psme1P97371 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Psme1P97371 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Psme1P97371 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Psme1P97371 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Psme1P97371 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Psme1P97371 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Psme1P97371 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Psme1P97371 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Psme1P97371 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Psme1P97371 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Psme1P97371 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Psme1P97371 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Psme1P97371 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Psme1P97371 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Psme1P97371 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Psme1P97371 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Psme1P97371 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Psme1P97371 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Psme1P97371 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Psme1P97371 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Psme1P97371 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Psme1P97371 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Psme1P97371 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Psme1P97371 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Psme1P97371 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Psme1P97371 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Psme1P97371 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Psme1P97371 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Psme1P97371 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Psme1P97371 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Psme1P97371 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Psme1P97371 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Psme1P97371 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Psme1P97371 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Psme1P97371 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Psme1P97371 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Psme1P97371 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Psme1P97371 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Psme1P97371 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Psme1P97371 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Psme1P97371 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Psme1P97371 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Psme1P97371 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Psme1P97371 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Psme1P97371 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms