Protein–RNA interactions for Protein: P86449

Trim43c, Tripartite motif-containing protein 43C, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim43cP86449 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim43cP86449 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim43cP86449 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim43cP86449 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim43cP86449 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim43cP86449 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim43cP86449 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim43cP86449 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim43cP86449 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim43cP86449 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim43cP86449 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim43cP86449 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim43cP86449 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim43cP86449 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim43cP86449 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim43cP86449 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim43cP86449 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim43cP86449 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim43cP86449 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim43cP86449 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim43cP86449 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim43cP86449 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim43cP86449 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim43cP86449 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim43cP86449 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim43cP86449 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim43cP86449 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Trim43cP86449 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim43cP86449 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim43cP86449 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim43cP86449 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim43cP86449 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim43cP86449 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim43cP86449 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim43cP86449 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim43cP86449 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim43cP86449 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim43cP86449 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim43cP86449 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim43cP86449 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim43cP86449 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim43cP86449 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim43cP86449 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim43cP86449 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim43cP86449 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim43cP86449 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim43cP86449 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim43cP86449 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim43cP86449 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim43cP86449 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim43cP86449 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim43cP86449 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim43cP86449 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim43cP86449 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Trim43cP86449 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim43cP86449 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim43cP86449 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim43cP86449 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim43cP86449 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim43cP86449 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim43cP86449 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Trim43cP86449 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Trim43cP86449 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim43cP86449 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim43cP86449 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim43cP86449 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim43cP86449 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim43cP86449 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim43cP86449 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim43cP86449 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim43cP86449 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim43cP86449 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim43cP86449 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim43cP86449 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim43cP86449 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim43cP86449 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim43cP86449 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim43cP86449 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim43cP86449 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim43cP86449 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim43cP86449 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim43cP86449 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim43cP86449 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim43cP86449 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim43cP86449 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim43cP86449 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim43cP86449 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim43cP86449 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim43cP86449 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim43cP86449 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim43cP86449 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim43cP86449 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim43cP86449 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms