Protein–RNA interactions for Protein: P85442

Vgll3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll3P85442 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vgll3P85442 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vgll3P85442 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vgll3P85442 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vgll3P85442 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Vgll3P85442 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vgll3P85442 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Vgll3P85442 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vgll3P85442 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vgll3P85442 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vgll3P85442 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vgll3P85442 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vgll3P85442 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vgll3P85442 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Vgll3P85442 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vgll3P85442 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vgll3P85442 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Vgll3P85442 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Vgll3P85442 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Vgll3P85442 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vgll3P85442 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vgll3P85442 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Vgll3P85442 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vgll3P85442 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vgll3P85442 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vgll3P85442 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vgll3P85442 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vgll3P85442 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vgll3P85442 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vgll3P85442 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vgll3P85442 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vgll3P85442 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vgll3P85442 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vgll3P85442 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vgll3P85442 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Vgll3P85442 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Vgll3P85442 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vgll3P85442 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vgll3P85442 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Vgll3P85442 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vgll3P85442 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vgll3P85442 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Vgll3P85442 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vgll3P85442 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vgll3P85442 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vgll3P85442 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vgll3P85442 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vgll3P85442 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Vgll3P85442 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vgll3P85442 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vgll3P85442 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vgll3P85442 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vgll3P85442 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vgll3P85442 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vgll3P85442 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vgll3P85442 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vgll3P85442 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vgll3P85442 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vgll3P85442 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Vgll3P85442 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vgll3P85442 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vgll3P85442 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Vgll3P85442 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vgll3P85442 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vgll3P85442 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vgll3P85442 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Vgll3P85442 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Vgll3P85442 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Vgll3P85442 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Vgll3P85442 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vgll3P85442 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vgll3P85442 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vgll3P85442 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vgll3P85442 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vgll3P85442 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vgll3P85442 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Vgll3P85442 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vgll3P85442 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vgll3P85442 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vgll3P85442 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vgll3P85442 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vgll3P85442 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Vgll3P85442 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vgll3P85442 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Vgll3P85442 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vgll3P85442 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vgll3P85442 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vgll3P85442 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Vgll3P85442 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vgll3P85442 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vgll3P85442 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vgll3P85442 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vgll3P85442 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Vgll3P85442 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Vgll3P85442 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Vgll3P85442 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Vgll3P85442 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vgll3P85442 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vgll3P85442 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vgll3P85442 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms