Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Irx1P81068 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Irx1P81068 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Irx1P81068 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Irx1P81068 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Irx1P81068 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Irx1P81068 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Irx1P81068 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Irx1P81068 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Irx1P81068 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Irx1P81068 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Irx1P81068 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Irx1P81068 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Irx1P81068 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Irx1P81068 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Irx1P81068 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Irx1P81068 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Irx1P81068 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Irx1P81068 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Irx1P81068 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Irx1P81068 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Irx1P81068 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Irx1P81068 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Irx1P81068 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Irx1P81068 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Irx1P81068 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Irx1P81068 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Irx1P81068 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Irx1P81068 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Irx1P81068 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Irx1P81068 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Irx1P81068 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Irx1P81068 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Irx1P81068 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Irx1P81068 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Irx1P81068 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Irx1P81068 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Irx1P81068 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Irx1P81068 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Irx1P81068 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Irx1P81068 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Irx1P81068 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Irx1P81068 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Irx1P81068 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Irx1P81068 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Irx1P81068 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Irx1P81068 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irx1P81068 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irx1P81068 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irx1P81068 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irx1P81068 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irx1P81068 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irx1P81068 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irx1P81068 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irx1P81068 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irx1P81068 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irx1P81068 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irx1P81068 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irx1P81068 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Irx1P81068 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Irx1P81068 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Irx1P81068 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irx1P81068 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irx1P81068 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irx1P81068 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irx1P81068 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irx1P81068 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irx1P81068 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irx1P81068 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irx1P81068 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irx1P81068 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irx1P81068 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Irx1P81068 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irx1P81068 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irx1P81068 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irx1P81068 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Irx1P81068 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Irx1P81068 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Irx1P81068 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Irx1P81068 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Irx1P81068 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Irx1P81068 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Irx1P81068 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Irx1P81068 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Irx1P81068 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Irx1P81068 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Irx1P81068 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Irx1P81068 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Irx1P81068 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Irx1P81068 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Irx1P81068 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Irx1P81068 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Irx1P81068 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Irx1P81068 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Irx1P81068 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Irx1P81068 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Irx1P81068 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Irx1P81068 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Irx1P81068 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Irx1P81068 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms