Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
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Usp9xP70398 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms