Protein–RNA interactions for Protein: P70298

Cux2, Homeobox protein cut-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux2P70298 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cux2P70298 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cux2P70298 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cux2P70298 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cux2P70298 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Cux2P70298 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cux2P70298 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Cux2P70298 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Cux2P70298 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cux2P70298 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Cux2P70298 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cux2P70298 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cux2P70298 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cux2P70298 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cux2P70298 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cux2P70298 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cux2P70298 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cux2P70298 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cux2P70298 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cux2P70298 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cux2P70298 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cux2P70298 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cux2P70298 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cux2P70298 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cux2P70298 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Cux2P70298 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cux2P70298 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cux2P70298 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Cux2P70298 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cux2P70298 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cux2P70298 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cux2P70298 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cux2P70298 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cux2P70298 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cux2P70298 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cux2P70298 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cux2P70298 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cux2P70298 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cux2P70298 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cux2P70298 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cux2P70298 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cux2P70298 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cux2P70298 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cux2P70298 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cux2P70298 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cux2P70298 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cux2P70298 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cux2P70298 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cux2P70298 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cux2P70298 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cux2P70298 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cux2P70298 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Cux2P70298 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cux2P70298 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cux2P70298 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cux2P70298 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cux2P70298 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Cux2P70298 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Cux2P70298 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cux2P70298 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Cux2P70298 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cux2P70298 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cux2P70298 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cux2P70298 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cux2P70298 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cux2P70298 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cux2P70298 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cux2P70298 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cux2P70298 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cux2P70298 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cux2P70298 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cux2P70298 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cux2P70298 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Cux2P70298 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cux2P70298 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cux2P70298 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Cux2P70298 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Cux2P70298 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cux2P70298 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cux2P70298 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cux2P70298 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cux2P70298 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cux2P70298 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cux2P70298 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cux2P70298 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cux2P70298 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cux2P70298 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cux2P70298 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Cux2P70298 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cux2P70298 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cux2P70298 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Cux2P70298 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Cux2P70298 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Cux2P70298 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cux2P70298 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Cux2P70298 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cux2P70298 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cux2P70298 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cux2P70298 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cux2P70298 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms