Protein–RNA interactions for Protein: P68372

Tubb4b, Tubulin beta-4B chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4bP68372 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tubb4bP68372 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tubb4bP68372 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tubb4bP68372 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tubb4bP68372 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tubb4bP68372 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tubb4bP68372 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tubb4bP68372 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tubb4bP68372 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tubb4bP68372 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tubb4bP68372 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tubb4bP68372 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tubb4bP68372 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tubb4bP68372 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tubb4bP68372 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tubb4bP68372 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tubb4bP68372 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tubb4bP68372 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Tubb4bP68372 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tubb4bP68372 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tubb4bP68372 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tubb4bP68372 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Tubb4bP68372 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tubb4bP68372 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tubb4bP68372 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tubb4bP68372 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tubb4bP68372 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tubb4bP68372 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tubb4bP68372 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tubb4bP68372 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tubb4bP68372 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tubb4bP68372 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tubb4bP68372 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tubb4bP68372 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tubb4bP68372 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tubb4bP68372 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tubb4bP68372 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tubb4bP68372 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tubb4bP68372 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tubb4bP68372 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tubb4bP68372 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tubb4bP68372 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tubb4bP68372 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tubb4bP68372 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tubb4bP68372 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tubb4bP68372 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tubb4bP68372 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tubb4bP68372 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tubb4bP68372 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Tubb4bP68372 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tubb4bP68372 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tubb4bP68372 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tubb4bP68372 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tubb4bP68372 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tubb4bP68372 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tubb4bP68372 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tubb4bP68372 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tubb4bP68372 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tubb4bP68372 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tubb4bP68372 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tubb4bP68372 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tubb4bP68372 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tubb4bP68372 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tubb4bP68372 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tubb4bP68372 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tubb4bP68372 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tubb4bP68372 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tubb4bP68372 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tubb4bP68372 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tubb4bP68372 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tubb4bP68372 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tubb4bP68372 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tubb4bP68372 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tubb4bP68372 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tubb4bP68372 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Tubb4bP68372 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tubb4bP68372 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tubb4bP68372 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tubb4bP68372 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tubb4bP68372 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tubb4bP68372 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tubb4bP68372 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tubb4bP68372 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tubb4bP68372 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tubb4bP68372 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tubb4bP68372 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tubb4bP68372 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tubb4bP68372 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tubb4bP68372 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tubb4bP68372 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tubb4bP68372 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tubb4bP68372 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tubb4bP68372 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tubb4bP68372 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tubb4bP68372 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tubb4bP68372 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tubb4bP68372 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tubb4bP68372 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tubb4bP68372 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tubb4bP68372 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms