Protein–RNA interactions for Protein: P62737

Acta2, Actin, aortic smooth muscle, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta2P62737 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Acta2P62737 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Acta2P62737 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Acta2P62737 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Acta2P62737 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Acta2P62737 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Acta2P62737 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Acta2P62737 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Acta2P62737 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Acta2P62737 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Acta2P62737 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Acta2P62737 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Acta2P62737 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Acta2P62737 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Acta2P62737 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Acta2P62737 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Acta2P62737 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Acta2P62737 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Acta2P62737 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Acta2P62737 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Acta2P62737 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Acta2P62737 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Acta2P62737 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Acta2P62737 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Acta2P62737 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Acta2P62737 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Acta2P62737 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Acta2P62737 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Acta2P62737 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Acta2P62737 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Acta2P62737 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Acta2P62737 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Acta2P62737 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Acta2P62737 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Acta2P62737 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Acta2P62737 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Acta2P62737 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Acta2P62737 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Acta2P62737 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Acta2P62737 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Acta2P62737 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Acta2P62737 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Acta2P62737 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Acta2P62737 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Acta2P62737 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Acta2P62737 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Acta2P62737 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Acta2P62737 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Acta2P62737 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Acta2P62737 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Acta2P62737 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Acta2P62737 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Acta2P62737 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Acta2P62737 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Acta2P62737 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Acta2P62737 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Acta2P62737 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Acta2P62737 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Acta2P62737 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Acta2P62737 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Acta2P62737 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Acta2P62737 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Acta2P62737 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Acta2P62737 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Acta2P62737 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Acta2P62737 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Acta2P62737 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Acta2P62737 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Acta2P62737 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Acta2P62737 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Acta2P62737 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Acta2P62737 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
Acta2P62737 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Acta2P62737 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Acta2P62737 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Acta2P62737 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Acta2P62737 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Acta2P62737 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Acta2P62737 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Acta2P62737 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Acta2P62737 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Acta2P62737 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Acta2P62737 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Acta2P62737 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Acta2P62737 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Acta2P62737 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Acta2P62737 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Acta2P62737 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Acta2P62737 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Acta2P62737 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Acta2P62737 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Acta2P62737 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Acta2P62737 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Acta2P62737 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Acta2P62737 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Acta2P62737 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Acta2P62737 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Acta2P62737 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Acta2P62737 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Acta2P62737 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms