Protein–RNA interactions for Protein: P62320

Snrpd3, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd3P62320 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Snrpd3P62320 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Snrpd3P62320 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Snrpd3P62320 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Snrpd3P62320 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Snrpd3P62320 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Snrpd3P62320 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Snrpd3P62320 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Snrpd3P62320 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Snrpd3P62320 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Snrpd3P62320 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Snrpd3P62320 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Snrpd3P62320 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Snrpd3P62320 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Snrpd3P62320 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Snrpd3P62320 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Snrpd3P62320 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Snrpd3P62320 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Snrpd3P62320 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Snrpd3P62320 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Snrpd3P62320 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Snrpd3P62320 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Snrpd3P62320 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Snrpd3P62320 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Snrpd3P62320 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Snrpd3P62320 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Snrpd3P62320 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Snrpd3P62320 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Snrpd3P62320 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Snrpd3P62320 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Snrpd3P62320 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Snrpd3P62320 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Snrpd3P62320 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Snrpd3P62320 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Snrpd3P62320 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Snrpd3P62320 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Snrpd3P62320 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Snrpd3P62320 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Snrpd3P62320 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Snrpd3P62320 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Snrpd3P62320 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Snrpd3P62320 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Snrpd3P62320 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Snrpd3P62320 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Snrpd3P62320 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Snrpd3P62320 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Snrpd3P62320 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Snrpd3P62320 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Snrpd3P62320 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Snrpd3P62320 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Snrpd3P62320 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Snrpd3P62320 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Snrpd3P62320 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Snrpd3P62320 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Snrpd3P62320 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Snrpd3P62320 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Snrpd3P62320 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Snrpd3P62320 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Snrpd3P62320 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Snrpd3P62320 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Snrpd3P62320 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Snrpd3P62320 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Snrpd3P62320 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Snrpd3P62320 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Snrpd3P62320 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Snrpd3P62320 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Snrpd3P62320 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Snrpd3P62320 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Snrpd3P62320 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Snrpd3P62320 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Snrpd3P62320 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Snrpd3P62320 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Snrpd3P62320 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Snrpd3P62320 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Snrpd3P62320 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Snrpd3P62320 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Snrpd3P62320 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Snrpd3P62320 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Snrpd3P62320 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Snrpd3P62320 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Snrpd3P62320 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Snrpd3P62320 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Snrpd3P62320 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Snrpd3P62320 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Snrpd3P62320 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Snrpd3P62320 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Snrpd3P62320 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Snrpd3P62320 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Snrpd3P62320 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Snrpd3P62320 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Snrpd3P62320 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Snrpd3P62320 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Snrpd3P62320 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Snrpd3P62320 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Snrpd3P62320 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Snrpd3P62320 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Snrpd3P62320 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Snrpd3P62320 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Snrpd3P62320 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Snrpd3P62320 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms