Protein–RNA interactions for Protein: P62307

Snrpf, Small nuclear ribonucleoprotein F, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpfP62307 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SnrpfP62307 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SnrpfP62307 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SnrpfP62307 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SnrpfP62307 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SnrpfP62307 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SnrpfP62307 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SnrpfP62307 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SnrpfP62307 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SnrpfP62307 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SnrpfP62307 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SnrpfP62307 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
SnrpfP62307 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SnrpfP62307 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SnrpfP62307 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SnrpfP62307 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SnrpfP62307 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SnrpfP62307 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SnrpfP62307 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SnrpfP62307 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SnrpfP62307 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SnrpfP62307 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SnrpfP62307 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SnrpfP62307 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SnrpfP62307 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SnrpfP62307 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SnrpfP62307 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SnrpfP62307 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SnrpfP62307 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SnrpfP62307 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SnrpfP62307 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SnrpfP62307 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SnrpfP62307 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SnrpfP62307 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SnrpfP62307 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SnrpfP62307 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SnrpfP62307 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SnrpfP62307 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SnrpfP62307 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SnrpfP62307 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SnrpfP62307 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SnrpfP62307 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SnrpfP62307 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SnrpfP62307 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SnrpfP62307 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SnrpfP62307 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SnrpfP62307 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SnrpfP62307 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SnrpfP62307 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SnrpfP62307 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SnrpfP62307 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SnrpfP62307 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SnrpfP62307 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SnrpfP62307 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SnrpfP62307 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SnrpfP62307 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SnrpfP62307 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SnrpfP62307 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SnrpfP62307 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SnrpfP62307 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SnrpfP62307 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SnrpfP62307 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SnrpfP62307 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SnrpfP62307 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SnrpfP62307 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SnrpfP62307 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SnrpfP62307 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SnrpfP62307 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SnrpfP62307 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SnrpfP62307 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SnrpfP62307 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SnrpfP62307 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SnrpfP62307 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SnrpfP62307 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SnrpfP62307 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SnrpfP62307 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SnrpfP62307 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SnrpfP62307 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SnrpfP62307 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SnrpfP62307 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SnrpfP62307 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SnrpfP62307 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SnrpfP62307 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SnrpfP62307 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SnrpfP62307 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SnrpfP62307 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SnrpfP62307 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SnrpfP62307 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SnrpfP62307 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SnrpfP62307 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SnrpfP62307 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SnrpfP62307 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SnrpfP62307 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SnrpfP62307 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SnrpfP62307 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SnrpfP62307 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SnrpfP62307 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SnrpfP62307 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SnrpfP62307 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SnrpfP62307 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms