Protein–RNA interactions for Protein: P61022

Chp1, Calcineurin B homologous protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chp1P61022 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chp1P61022 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chp1P61022 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chp1P61022 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chp1P61022 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chp1P61022 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chp1P61022 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chp1P61022 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chp1P61022 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Chp1P61022 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Chp1P61022 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chp1P61022 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chp1P61022 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chp1P61022 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Chp1P61022 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chp1P61022 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chp1P61022 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chp1P61022 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chp1P61022 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chp1P61022 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chp1P61022 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chp1P61022 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chp1P61022 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chp1P61022 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chp1P61022 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chp1P61022 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chp1P61022 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chp1P61022 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chp1P61022 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chp1P61022 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chp1P61022 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Chp1P61022 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chp1P61022 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chp1P61022 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chp1P61022 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chp1P61022 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chp1P61022 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chp1P61022 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chp1P61022 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chp1P61022 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chp1P61022 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chp1P61022 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chp1P61022 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chp1P61022 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chp1P61022 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chp1P61022 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chp1P61022 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chp1P61022 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Chp1P61022 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chp1P61022 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chp1P61022 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chp1P61022 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chp1P61022 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Chp1P61022 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chp1P61022 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chp1P61022 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chp1P61022 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chp1P61022 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chp1P61022 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chp1P61022 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chp1P61022 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chp1P61022 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chp1P61022 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chp1P61022 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chp1P61022 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chp1P61022 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chp1P61022 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chp1P61022 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chp1P61022 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chp1P61022 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chp1P61022 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chp1P61022 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chp1P61022 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chp1P61022 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chp1P61022 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chp1P61022 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chp1P61022 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Chp1P61022 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Chp1P61022 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chp1P61022 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chp1P61022 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chp1P61022 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chp1P61022 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chp1P61022 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chp1P61022 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chp1P61022 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Chp1P61022 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chp1P61022 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chp1P61022 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chp1P61022 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chp1P61022 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chp1P61022 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Chp1P61022 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chp1P61022 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Chp1P61022 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chp1P61022 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chp1P61022 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chp1P61022 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chp1P61022 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chp1P61022 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms