Protein–RNA interactions for Protein: P61014

Pln, Cardiac phospholamban, mousemouse

Predictions only

Length 52 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PlnP61014 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PlnP61014 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PlnP61014 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PlnP61014 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PlnP61014 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PlnP61014 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PlnP61014 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PlnP61014 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PlnP61014 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PlnP61014 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PlnP61014 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PlnP61014 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PlnP61014 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PlnP61014 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PlnP61014 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PlnP61014 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PlnP61014 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PlnP61014 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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PlnP61014 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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PlnP61014 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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PlnP61014 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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PlnP61014 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
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PlnP61014 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PlnP61014 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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PlnP61014 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PlnP61014 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PlnP61014 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PlnP61014 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PlnP61014 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PlnP61014 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PlnP61014 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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PlnP61014 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PlnP61014 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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PlnP61014 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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PlnP61014 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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PlnP61014 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PlnP61014 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PlnP61014 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PlnP61014 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PlnP61014 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PlnP61014 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PlnP61014 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PlnP61014 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PlnP61014 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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PlnP61014 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PlnP61014 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PlnP61014 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PlnP61014 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms