Protein–RNA interactions for Protein: P60824

Cirbp, Cold-inducible RNA-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CirbpP60824 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CirbpP60824 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CirbpP60824 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CirbpP60824 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CirbpP60824 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CirbpP60824 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CirbpP60824 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CirbpP60824 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
CirbpP60824 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CirbpP60824 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CirbpP60824 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CirbpP60824 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CirbpP60824 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CirbpP60824 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CirbpP60824 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CirbpP60824 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CirbpP60824 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CirbpP60824 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CirbpP60824 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CirbpP60824 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CirbpP60824 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CirbpP60824 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CirbpP60824 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CirbpP60824 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CirbpP60824 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CirbpP60824 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CirbpP60824 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CirbpP60824 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CirbpP60824 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CirbpP60824 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CirbpP60824 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CirbpP60824 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CirbpP60824 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CirbpP60824 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CirbpP60824 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CirbpP60824 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CirbpP60824 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
CirbpP60824 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CirbpP60824 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CirbpP60824 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CirbpP60824 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CirbpP60824 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CirbpP60824 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CirbpP60824 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CirbpP60824 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CirbpP60824 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CirbpP60824 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CirbpP60824 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CirbpP60824 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CirbpP60824 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CirbpP60824 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CirbpP60824 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CirbpP60824 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
CirbpP60824 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
CirbpP60824 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CirbpP60824 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
CirbpP60824 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
CirbpP60824 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
CirbpP60824 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CirbpP60824 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CirbpP60824 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CirbpP60824 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CirbpP60824 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CirbpP60824 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CirbpP60824 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CirbpP60824 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CirbpP60824 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CirbpP60824 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CirbpP60824 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CirbpP60824 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CirbpP60824 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CirbpP60824 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CirbpP60824 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CirbpP60824 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CirbpP60824 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CirbpP60824 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CirbpP60824 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CirbpP60824 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CirbpP60824 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CirbpP60824 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CirbpP60824 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CirbpP60824 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
CirbpP60824 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
CirbpP60824 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
CirbpP60824 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
CirbpP60824 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
CirbpP60824 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
CirbpP60824 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms