Protein–RNA interactions for Protein: P60710

Actb, Actin, cytoplasmic 1, mousemouse

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ActbP60710 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ActbP60710 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ActbP60710 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ActbP60710 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ActbP60710 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ActbP60710 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ActbP60710 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ActbP60710 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ActbP60710 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ActbP60710 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ActbP60710 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ActbP60710 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ActbP60710 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ActbP60710 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ActbP60710 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ActbP60710 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ActbP60710 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ActbP60710 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ActbP60710 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ActbP60710 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ActbP60710 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ActbP60710 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ActbP60710 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ActbP60710 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ActbP60710 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ActbP60710 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ActbP60710 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ActbP60710 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
ActbP60710 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ActbP60710 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
ActbP60710 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ActbP60710 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ActbP60710 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ActbP60710 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ActbP60710 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ActbP60710 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
ActbP60710 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ActbP60710 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ActbP60710 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ActbP60710 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ActbP60710 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ActbP60710 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ActbP60710 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ActbP60710 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ActbP60710 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ActbP60710 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ActbP60710 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
ActbP60710 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ActbP60710 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
ActbP60710 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ActbP60710 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ActbP60710 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
ActbP60710 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ActbP60710 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
ActbP60710 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ActbP60710 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
ActbP60710 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
ActbP60710 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
ActbP60710 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
ActbP60710 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ActbP60710 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
ActbP60710 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
ActbP60710 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
ActbP60710 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ActbP60710 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ActbP60710 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ActbP60710 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ActbP60710 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ActbP60710 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ActbP60710 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ActbP60710 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
ActbP60710 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
ActbP60710 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
ActbP60710 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
ActbP60710 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
ActbP60710 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
ActbP60710 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
ActbP60710 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
ActbP60710 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
ActbP60710 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
ActbP60710 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
ActbP60710 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ActbP60710 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ActbP60710 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ActbP60710 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ActbP60710 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ActbP60710 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ActbP60710 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ActbP60710 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ActbP60710 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ActbP60710 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ActbP60710 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ActbP60710 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
ActbP60710 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ActbP60710 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ActbP60710 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ActbP60710 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ActbP60710 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ActbP60710 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ActbP60710 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms