Protein–RNA interactions for Protein: P59729

Rin3, Ras and Rab interactor 3, mousemouse

Predictions only

Length 980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rin3P59729 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rin3P59729 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rin3P59729 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rin3P59729 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rin3P59729 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rin3P59729 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rin3P59729 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rin3P59729 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rin3P59729 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rin3P59729 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rin3P59729 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Rin3P59729 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rin3P59729 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rin3P59729 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rin3P59729 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rin3P59729 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rin3P59729 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rin3P59729 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rin3P59729 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Rin3P59729 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rin3P59729 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rin3P59729 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rin3P59729 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Rin3P59729 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rin3P59729 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rin3P59729 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rin3P59729 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rin3P59729 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rin3P59729 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rin3P59729 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rin3P59729 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rin3P59729 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rin3P59729 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rin3P59729 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rin3P59729 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rin3P59729 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rin3P59729 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rin3P59729 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rin3P59729 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rin3P59729 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rin3P59729 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rin3P59729 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rin3P59729 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rin3P59729 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rin3P59729 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rin3P59729 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rin3P59729 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rin3P59729 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rin3P59729 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rin3P59729 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rin3P59729 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rin3P59729 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rin3P59729 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rin3P59729 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rin3P59729 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Rin3P59729 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rin3P59729 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rin3P59729 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rin3P59729 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rin3P59729 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rin3P59729 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rin3P59729 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rin3P59729 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rin3P59729 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rin3P59729 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rin3P59729 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rin3P59729 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rin3P59729 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rin3P59729 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Rin3P59729 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rin3P59729 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Rin3P59729 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rin3P59729 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rin3P59729 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rin3P59729 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rin3P59729 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rin3P59729 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Rin3P59729 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rin3P59729 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rin3P59729 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rin3P59729 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rin3P59729 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Rin3P59729 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rin3P59729 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rin3P59729 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rin3P59729 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rin3P59729 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rin3P59729 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rin3P59729 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rin3P59729 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rin3P59729 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rin3P59729 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rin3P59729 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rin3P59729 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rin3P59729 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rin3P59729 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rin3P59729 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rin3P59729 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rin3P59729 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rin3P59729 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms