Protein–RNA interactions for Protein: P58873

Rhbdl3, Rhomboid-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl3P58873 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rhbdl3P58873 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rhbdl3P58873 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Rhbdl3P58873 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rhbdl3P58873 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rhbdl3P58873 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rhbdl3P58873 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rhbdl3P58873 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rhbdl3P58873 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rhbdl3P58873 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rhbdl3P58873 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rhbdl3P58873 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rhbdl3P58873 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rhbdl3P58873 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rhbdl3P58873 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rhbdl3P58873 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rhbdl3P58873 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rhbdl3P58873 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Rhbdl3P58873 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rhbdl3P58873 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rhbdl3P58873 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rhbdl3P58873 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rhbdl3P58873 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Rhbdl3P58873 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rhbdl3P58873 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rhbdl3P58873 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rhbdl3P58873 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rhbdl3P58873 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rhbdl3P58873 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rhbdl3P58873 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rhbdl3P58873 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rhbdl3P58873 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rhbdl3P58873 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rhbdl3P58873 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rhbdl3P58873 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rhbdl3P58873 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rhbdl3P58873 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rhbdl3P58873 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rhbdl3P58873 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Rhbdl3P58873 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rhbdl3P58873 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rhbdl3P58873 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Rhbdl3P58873 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rhbdl3P58873 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rhbdl3P58873 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rhbdl3P58873 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rhbdl3P58873 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rhbdl3P58873 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rhbdl3P58873 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rhbdl3P58873 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rhbdl3P58873 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rhbdl3P58873 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rhbdl3P58873 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rhbdl3P58873 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rhbdl3P58873 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rhbdl3P58873 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rhbdl3P58873 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rhbdl3P58873 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rhbdl3P58873 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rhbdl3P58873 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rhbdl3P58873 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rhbdl3P58873 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rhbdl3P58873 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rhbdl3P58873 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rhbdl3P58873 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rhbdl3P58873 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rhbdl3P58873 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rhbdl3P58873 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rhbdl3P58873 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rhbdl3P58873 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rhbdl3P58873 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rhbdl3P58873 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rhbdl3P58873 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Rhbdl3P58873 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rhbdl3P58873 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rhbdl3P58873 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rhbdl3P58873 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rhbdl3P58873 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rhbdl3P58873 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rhbdl3P58873 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rhbdl3P58873 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rhbdl3P58873 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rhbdl3P58873 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rhbdl3P58873 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rhbdl3P58873 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rhbdl3P58873 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rhbdl3P58873 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rhbdl3P58873 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rhbdl3P58873 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rhbdl3P58873 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rhbdl3P58873 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rhbdl3P58873 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rhbdl3P58873 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rhbdl3P58873 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rhbdl3P58873 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rhbdl3P58873 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rhbdl3P58873 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rhbdl3P58873 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Rhbdl3P58873 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Rhbdl3P58873 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms