Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

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Length 1,055 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp25P57080 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp25P57080 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp25P57080 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp25P57080 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp25P57080 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp25P57080 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp25P57080 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp25P57080 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp25P57080 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp25P57080 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp25P57080 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp25P57080 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp25P57080 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp25P57080 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp25P57080 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp25P57080 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp25P57080 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp25P57080 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp25P57080 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp25P57080 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp25P57080 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp25P57080 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp25P57080 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp25P57080 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp25P57080 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp25P57080 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp25P57080 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp25P57080 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp25P57080 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp25P57080 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp25P57080 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp25P57080 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp25P57080 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp25P57080 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp25P57080 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp25P57080 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp25P57080 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp25P57080 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp25P57080 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp25P57080 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Usp25P57080 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp25P57080 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Usp25P57080 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp25P57080 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp25P57080 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp25P57080 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp25P57080 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp25P57080 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp25P57080 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp25P57080 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp25P57080 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp25P57080 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Usp25P57080 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp25P57080 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp25P57080 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp25P57080 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Usp25P57080 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp25P57080 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Usp25P57080 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp25P57080 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp25P57080 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp25P57080 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp25P57080 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp25P57080 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp25P57080 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Usp25P57080 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp25P57080 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp25P57080 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp25P57080 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp25P57080 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp25P57080 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp25P57080 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp25P57080 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp25P57080 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp25P57080 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp25P57080 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp25P57080 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp25P57080 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp25P57080 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp25P57080 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp25P57080 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp25P57080 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp25P57080 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Usp25P57080 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Usp25P57080 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Usp25P57080 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Usp25P57080 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Usp25P57080 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Usp25P57080 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp25P57080 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp25P57080 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp25P57080 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms