Protein–RNA interactions for Protein: P56563

Lim2, Lens fiber membrane intrinsic protein, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lim2P56563 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lim2P56563 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Lim2P56563 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Lim2P56563 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lim2P56563 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms