Protein–RNA interactions for Protein: P56203

Ctsw, Cathepsin W, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtswP56203 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CtswP56203 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CtswP56203 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtswP56203 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtswP56203 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtswP56203 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtswP56203 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtswP56203 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtswP56203 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtswP56203 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtswP56203 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtswP56203 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtswP56203 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtswP56203 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtswP56203 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtswP56203 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CtswP56203 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtswP56203 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtswP56203 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CtswP56203 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtswP56203 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtswP56203 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtswP56203 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtswP56203 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtswP56203 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtswP56203 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtswP56203 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtswP56203 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CtswP56203 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtswP56203 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtswP56203 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CtswP56203 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtswP56203 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CtswP56203 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtswP56203 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtswP56203 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtswP56203 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtswP56203 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtswP56203 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtswP56203 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtswP56203 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtswP56203 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtswP56203 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtswP56203 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtswP56203 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtswP56203 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtswP56203 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtswP56203 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
CtswP56203 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CtswP56203 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CtswP56203 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CtswP56203 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CtswP56203 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CtswP56203 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CtswP56203 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CtswP56203 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CtswP56203 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CtswP56203 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CtswP56203 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CtswP56203 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CtswP56203 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CtswP56203 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CtswP56203 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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CtswP56203 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CtswP56203 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CtswP56203 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CtswP56203 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.08■□□□□ 0
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CtswP56203 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CtswP56203 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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CtswP56203 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CtswP56203 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CtswP56203 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CtswP56203 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CtswP56203 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CtswP56203 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CtswP56203 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtswP56203 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CtswP56203 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CtswP56203 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtswP56203 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CtswP56203 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtswP56203 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CtswP56203 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtswP56203 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtswP56203 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtswP56203 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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CtswP56203 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtswP56203 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CtswP56203 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtswP56203 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CtswP56203 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtswP56203 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtswP56203 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtswP56203 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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