Protein–RNA interactions for Protein: P54754

Ephb3, Ephrin type-B receptor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb3P54754 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms