Protein–RNA interactions for Protein: P53612

Rabggtb, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtbP53612 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RabggtbP53612 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RabggtbP53612 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RabggtbP53612 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RabggtbP53612 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RabggtbP53612 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RabggtbP53612 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RabggtbP53612 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RabggtbP53612 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RabggtbP53612 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RabggtbP53612 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RabggtbP53612 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RabggtbP53612 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RabggtbP53612 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RabggtbP53612 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RabggtbP53612 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RabggtbP53612 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RabggtbP53612 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RabggtbP53612 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RabggtbP53612 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RabggtbP53612 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RabggtbP53612 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RabggtbP53612 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RabggtbP53612 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RabggtbP53612 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RabggtbP53612 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RabggtbP53612 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RabggtbP53612 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RabggtbP53612 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RabggtbP53612 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RabggtbP53612 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RabggtbP53612 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RabggtbP53612 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RabggtbP53612 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RabggtbP53612 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RabggtbP53612 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
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