Protein–RNA interactions for Protein: P53349

Map3k1, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map3k1P53349 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Map3k1P53349 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Map3k1P53349 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Map3k1P53349 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Map3k1P53349 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Map3k1P53349 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Map3k1P53349 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Map3k1P53349 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Map3k1P53349 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Map3k1P53349 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Map3k1P53349 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Map3k1P53349 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Map3k1P53349 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Map3k1P53349 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Map3k1P53349 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Map3k1P53349 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Map3k1P53349 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Map3k1P53349 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Map3k1P53349 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Map3k1P53349 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Map3k1P53349 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Map3k1P53349 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Map3k1P53349 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Map3k1P53349 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Map3k1P53349 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Map3k1P53349 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Map3k1P53349 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Map3k1P53349 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Map3k1P53349 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Map3k1P53349 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Map3k1P53349 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Map3k1P53349 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Map3k1P53349 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Map3k1P53349 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Map3k1P53349 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Map3k1P53349 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Map3k1P53349 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Map3k1P53349 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Map3k1P53349 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Map3k1P53349 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Map3k1P53349 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Map3k1P53349 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Map3k1P53349 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Map3k1P53349 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Map3k1P53349 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Map3k1P53349 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Map3k1P53349 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Map3k1P53349 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Map3k1P53349 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Map3k1P53349 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Map3k1P53349 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Map3k1P53349 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Map3k1P53349 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Map3k1P53349 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Map3k1P53349 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Map3k1P53349 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Map3k1P53349 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Map3k1P53349 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Map3k1P53349 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Map3k1P53349 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Map3k1P53349 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Map3k1P53349 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Map3k1P53349 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Map3k1P53349 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Map3k1P53349 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Map3k1P53349 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Map3k1P53349 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Map3k1P53349 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Map3k1P53349 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Map3k1P53349 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Map3k1P53349 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Map3k1P53349 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Map3k1P53349 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Map3k1P53349 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Map3k1P53349 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Map3k1P53349 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Map3k1P53349 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Map3k1P53349 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Map3k1P53349 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Map3k1P53349 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Map3k1P53349 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Map3k1P53349 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Map3k1P53349 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Map3k1P53349 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Map3k1P53349 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Map3k1P53349 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Map3k1P53349 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Map3k1P53349 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Map3k1P53349 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Map3k1P53349 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Map3k1P53349 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Map3k1P53349 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Map3k1P53349 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Map3k1P53349 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Map3k1P53349 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Map3k1P53349 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Map3k1P53349 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Map3k1P53349 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Map3k1P53349 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Map3k1P53349 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.5 ms