Protein–RNA interactions for Protein: P51180

Mip, Lens fiber major intrinsic protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MipP51180 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
MipP51180 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
MipP51180 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MipP51180 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
MipP51180 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MipP51180 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
MipP51180 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MipP51180 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MipP51180 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MipP51180 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
MipP51180 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MipP51180 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MipP51180 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
MipP51180 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MipP51180 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
MipP51180 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MipP51180 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MipP51180 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
MipP51180 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
MipP51180 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MipP51180 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
MipP51180 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
MipP51180 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
MipP51180 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
MipP51180 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
MipP51180 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MipP51180 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
MipP51180 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
MipP51180 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MipP51180 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
MipP51180 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
MipP51180 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
MipP51180 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
MipP51180 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MipP51180 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
MipP51180 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MipP51180 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MipP51180 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MipP51180 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MipP51180 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MipP51180 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MipP51180 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
MipP51180 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MipP51180 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MipP51180 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MipP51180 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MipP51180 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MipP51180 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MipP51180 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MipP51180 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MipP51180 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MipP51180 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MipP51180 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MipP51180 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MipP51180 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MipP51180 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MipP51180 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
MipP51180 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MipP51180 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MipP51180 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MipP51180 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MipP51180 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MipP51180 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MipP51180 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MipP51180 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MipP51180 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MipP51180 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MipP51180 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
MipP51180 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MipP51180 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MipP51180 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MipP51180 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MipP51180 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MipP51180 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MipP51180 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MipP51180 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MipP51180 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MipP51180 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MipP51180 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MipP51180 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MipP51180 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MipP51180 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MipP51180 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MipP51180 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MipP51180 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MipP51180 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MipP51180 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MipP51180 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MipP51180 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MipP51180 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MipP51180 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MipP51180 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MipP51180 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MipP51180 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MipP51180 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
MipP51180 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MipP51180 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MipP51180 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MipP51180 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MipP51180 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms