Protein–RNA interactions for Protein: P49194

Rbp3, Retinol-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp3P49194 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rbp3P49194 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rbp3P49194 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rbp3P49194 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Rbp3P49194 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rbp3P49194 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rbp3P49194 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rbp3P49194 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rbp3P49194 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Rbp3P49194 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rbp3P49194 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rbp3P49194 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rbp3P49194 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rbp3P49194 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rbp3P49194 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms