Protein–RNA interactions for Protein: P48772

Cox8b, Cytochrome c oxidase subunit 8B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 70 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox8bP48772 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms