Protein–RNA interactions for Protein: P48678

Lmna, Prelamin-A/C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LmnaP48678 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LmnaP48678 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LmnaP48678 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LmnaP48678 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LmnaP48678 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LmnaP48678 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LmnaP48678 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LmnaP48678 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LmnaP48678 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LmnaP48678 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LmnaP48678 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LmnaP48678 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LmnaP48678 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LmnaP48678 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LmnaP48678 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LmnaP48678 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LmnaP48678 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LmnaP48678 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LmnaP48678 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LmnaP48678 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LmnaP48678 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LmnaP48678 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LmnaP48678 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LmnaP48678 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LmnaP48678 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LmnaP48678 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LmnaP48678 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LmnaP48678 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LmnaP48678 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LmnaP48678 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LmnaP48678 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LmnaP48678 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LmnaP48678 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LmnaP48678 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LmnaP48678 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LmnaP48678 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LmnaP48678 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LmnaP48678 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LmnaP48678 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LmnaP48678 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LmnaP48678 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LmnaP48678 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LmnaP48678 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LmnaP48678 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LmnaP48678 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LmnaP48678 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LmnaP48678 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LmnaP48678 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LmnaP48678 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LmnaP48678 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LmnaP48678 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LmnaP48678 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LmnaP48678 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LmnaP48678 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LmnaP48678 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LmnaP48678 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LmnaP48678 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LmnaP48678 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
LmnaP48678 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
LmnaP48678 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
LmnaP48678 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
LmnaP48678 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LmnaP48678 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LmnaP48678 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LmnaP48678 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LmnaP48678 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LmnaP48678 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LmnaP48678 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LmnaP48678 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LmnaP48678 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LmnaP48678 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LmnaP48678 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LmnaP48678 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
LmnaP48678 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LmnaP48678 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LmnaP48678 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LmnaP48678 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LmnaP48678 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LmnaP48678 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LmnaP48678 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LmnaP48678 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LmnaP48678 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LmnaP48678 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LmnaP48678 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LmnaP48678 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LmnaP48678 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LmnaP48678 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LmnaP48678 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LmnaP48678 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LmnaP48678 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LmnaP48678 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LmnaP48678 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LmnaP48678 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LmnaP48678 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LmnaP48678 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LmnaP48678 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LmnaP48678 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LmnaP48678 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LmnaP48678 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LmnaP48678 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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