Protein–RNA interactions for Protein: P47963

Rpl13, 60S ribosomal protein L13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13P47963 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms