Protein–RNA interactions for Protein: P46096

Syt1, Synaptotagmin-1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt1P46096 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syt1P46096 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syt1P46096 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syt1P46096 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syt1P46096 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Syt1P46096 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syt1P46096 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syt1P46096 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Syt1P46096 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syt1P46096 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Syt1P46096 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Syt1P46096 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syt1P46096 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syt1P46096 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syt1P46096 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syt1P46096 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syt1P46096 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syt1P46096 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Syt1P46096 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syt1P46096 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syt1P46096 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syt1P46096 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syt1P46096 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syt1P46096 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syt1P46096 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syt1P46096 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syt1P46096 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syt1P46096 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syt1P46096 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syt1P46096 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syt1P46096 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syt1P46096 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syt1P46096 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Syt1P46096 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syt1P46096 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syt1P46096 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syt1P46096 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Syt1P46096 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syt1P46096 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syt1P46096 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syt1P46096 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syt1P46096 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syt1P46096 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syt1P46096 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Syt1P46096 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Syt1P46096 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syt1P46096 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syt1P46096 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syt1P46096 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syt1P46096 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syt1P46096 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syt1P46096 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syt1P46096 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syt1P46096 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syt1P46096 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syt1P46096 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syt1P46096 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syt1P46096 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syt1P46096 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syt1P46096 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syt1P46096 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syt1P46096 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syt1P46096 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syt1P46096 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syt1P46096 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syt1P46096 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syt1P46096 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syt1P46096 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Syt1P46096 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syt1P46096 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syt1P46096 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syt1P46096 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syt1P46096 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syt1P46096 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syt1P46096 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syt1P46096 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syt1P46096 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syt1P46096 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syt1P46096 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syt1P46096 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syt1P46096 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syt1P46096 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syt1P46096 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syt1P46096 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syt1P46096 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syt1P46096 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syt1P46096 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syt1P46096 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syt1P46096 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syt1P46096 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syt1P46096 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syt1P46096 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syt1P46096 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syt1P46096 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Syt1P46096 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syt1P46096 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syt1P46096 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syt1P46096 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syt1P46096 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syt1P46096 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms