Protein–RNA interactions for Protein: P39429

Traf2, TNF receptor-associated factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf2P39429 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Traf2P39429 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Traf2P39429 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Traf2P39429 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Traf2P39429 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Traf2P39429 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Traf2P39429 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Traf2P39429 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Traf2P39429 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Traf2P39429 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Traf2P39429 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Traf2P39429 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Traf2P39429 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Traf2P39429 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Traf2P39429 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Traf2P39429 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Traf2P39429 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Traf2P39429 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Traf2P39429 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Traf2P39429 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Traf2P39429 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Traf2P39429 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Traf2P39429 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Traf2P39429 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Traf2P39429 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Traf2P39429 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Traf2P39429 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Traf2P39429 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Traf2P39429 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Traf2P39429 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Traf2P39429 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Traf2P39429 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Traf2P39429 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Traf2P39429 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Traf2P39429 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Traf2P39429 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Traf2P39429 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Traf2P39429 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Traf2P39429 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Traf2P39429 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Traf2P39429 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Traf2P39429 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Traf2P39429 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Traf2P39429 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Traf2P39429 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Traf2P39429 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Traf2P39429 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Traf2P39429 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Traf2P39429 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Traf2P39429 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Traf2P39429 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Traf2P39429 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Traf2P39429 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Traf2P39429 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Traf2P39429 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Traf2P39429 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Traf2P39429 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Traf2P39429 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Traf2P39429 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Traf2P39429 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Traf2P39429 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Traf2P39429 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Traf2P39429 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Traf2P39429 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Traf2P39429 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Traf2P39429 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Traf2P39429 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Traf2P39429 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Traf2P39429 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Traf2P39429 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Traf2P39429 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Traf2P39429 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Traf2P39429 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Traf2P39429 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Traf2P39429 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Traf2P39429 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Traf2P39429 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Traf2P39429 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Traf2P39429 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Traf2P39429 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Traf2P39429 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Traf2P39429 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Traf2P39429 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Traf2P39429 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Traf2P39429 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Traf2P39429 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Traf2P39429 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Traf2P39429 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Traf2P39429 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Traf2P39429 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Traf2P39429 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Traf2P39429 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Traf2P39429 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Traf2P39429 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Traf2P39429 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Traf2P39429 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Traf2P39429 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Traf2P39429 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Traf2P39429 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Traf2P39429 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms