Protein–RNA interactions for Protein: P35639

Ddit3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddit3P35639 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ddit3P35639 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ddit3P35639 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ddit3P35639 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ddit3P35639 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ddit3P35639 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ddit3P35639 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ddit3P35639 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ddit3P35639 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ddit3P35639 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ddit3P35639 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ddit3P35639 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ddit3P35639 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ddit3P35639 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ddit3P35639 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ddit3P35639 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ddit3P35639 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ddit3P35639 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ddit3P35639 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ddit3P35639 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ddit3P35639 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ddit3P35639 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Ddit3P35639 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ddit3P35639 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ddit3P35639 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ddit3P35639 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ddit3P35639 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ddit3P35639 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Ddit3P35639 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ddit3P35639 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ddit3P35639 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ddit3P35639 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Ddit3P35639 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ddit3P35639 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ddit3P35639 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ddit3P35639 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ddit3P35639 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ddit3P35639 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ddit3P35639 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ddit3P35639 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ddit3P35639 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ddit3P35639 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ddit3P35639 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ddit3P35639 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ddit3P35639 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ddit3P35639 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ddit3P35639 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ddit3P35639 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ddit3P35639 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ddit3P35639 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ddit3P35639 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ddit3P35639 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ddit3P35639 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ddit3P35639 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ddit3P35639 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ddit3P35639 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ddit3P35639 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ddit3P35639 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ddit3P35639 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ddit3P35639 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ddit3P35639 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ddit3P35639 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ddit3P35639 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ddit3P35639 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ddit3P35639 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ddit3P35639 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ddit3P35639 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ddit3P35639 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ddit3P35639 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ddit3P35639 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ddit3P35639 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ddit3P35639 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ddit3P35639 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ddit3P35639 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ddit3P35639 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ddit3P35639 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ddit3P35639 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ddit3P35639 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ddit3P35639 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ddit3P35639 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ddit3P35639 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ddit3P35639 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ddit3P35639 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ddit3P35639 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ddit3P35639 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ddit3P35639 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ddit3P35639 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ddit3P35639 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ddit3P35639 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ddit3P35639 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ddit3P35639 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ddit3P35639 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ddit3P35639 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ddit3P35639 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ddit3P35639 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ddit3P35639 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ddit3P35639 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ddit3P35639 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ddit3P35639 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ddit3P35639 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms