Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nedd1P33215 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nedd1P33215 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nedd1P33215 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nedd1P33215 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nedd1P33215 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nedd1P33215 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Nedd1P33215 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nedd1P33215 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Nedd1P33215 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Nedd1P33215 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nedd1P33215 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nedd1P33215 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nedd1P33215 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nedd1P33215 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nedd1P33215 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nedd1P33215 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nedd1P33215 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nedd1P33215 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nedd1P33215 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nedd1P33215 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nedd1P33215 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nedd1P33215 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nedd1P33215 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Nedd1P33215 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nedd1P33215 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nedd1P33215 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nedd1P33215 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nedd1P33215 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Nedd1P33215 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nedd1P33215 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nedd1P33215 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Nedd1P33215 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Nedd1P33215 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nedd1P33215 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nedd1P33215 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nedd1P33215 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nedd1P33215 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nedd1P33215 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nedd1P33215 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nedd1P33215 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nedd1P33215 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nedd1P33215 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Nedd1P33215 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nedd1P33215 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nedd1P33215 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nedd1P33215 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Nedd1P33215 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nedd1P33215 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nedd1P33215 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nedd1P33215 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nedd1P33215 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nedd1P33215 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Nedd1P33215 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nedd1P33215 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nedd1P33215 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Nedd1P33215 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nedd1P33215 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Nedd1P33215 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nedd1P33215 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nedd1P33215 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nedd1P33215 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nedd1P33215 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nedd1P33215 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nedd1P33215 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Nedd1P33215 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nedd1P33215 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nedd1P33215 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nedd1P33215 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nedd1P33215 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nedd1P33215 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nedd1P33215 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nedd1P33215 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nedd1P33215 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nedd1P33215 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nedd1P33215 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nedd1P33215 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nedd1P33215 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nedd1P33215 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nedd1P33215 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Nedd1P33215 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nedd1P33215 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Nedd1P33215 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Nedd1P33215 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nedd1P33215 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nedd1P33215 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nedd1P33215 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Nedd1P33215 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nedd1P33215 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nedd1P33215 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nedd1P33215 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nedd1P33215 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nedd1P33215 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nedd1P33215 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nedd1P33215 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nedd1P33215 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nedd1P33215 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nedd1P33215 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nedd1P33215 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nedd1P33215 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms