Protein–RNA interactions for Protein: P29341

Pabpc1, Polyadenylate-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1P29341 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms