Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RxrgP28705 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RxrgP28705 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RxrgP28705 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RxrgP28705 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
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RxrgP28705 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
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RxrgP28705 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
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RxrgP28705 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RxrgP28705 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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