Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Psmb9P28076 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Psmb9P28076 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Psmb9P28076 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Psmb9P28076 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Psmb9P28076 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Psmb9P28076 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Psmb9P28076 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Psmb9P28076 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Psmb9P28076 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Psmb9P28076 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Psmb9P28076 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Psmb9P28076 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Psmb9P28076 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Psmb9P28076 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Psmb9P28076 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Psmb9P28076 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Psmb9P28076 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Psmb9P28076 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Psmb9P28076 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Psmb9P28076 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Psmb9P28076 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Psmb9P28076 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Psmb9P28076 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Psmb9P28076 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Psmb9P28076 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Psmb9P28076 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Psmb9P28076 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Psmb9P28076 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Psmb9P28076 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Psmb9P28076 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Psmb9P28076 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Psmb9P28076 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Psmb9P28076 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Psmb9P28076 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Psmb9P28076 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Psmb9P28076 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Psmb9P28076 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Psmb9P28076 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Psmb9P28076 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Psmb9P28076 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Psmb9P28076 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Psmb9P28076 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Psmb9P28076 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Psmb9P28076 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Psmb9P28076 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Psmb9P28076 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Psmb9P28076 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Psmb9P28076 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Psmb9P28076 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Psmb9P28076 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Psmb9P28076 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Psmb9P28076 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Psmb9P28076 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Psmb9P28076 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Psmb9P28076 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Psmb9P28076 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Psmb9P28076 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Psmb9P28076 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Psmb9P28076 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Psmb9P28076 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Psmb9P28076 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Psmb9P28076 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Psmb9P28076 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Psmb9P28076 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Psmb9P28076 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Psmb9P28076 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Psmb9P28076 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Psmb9P28076 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Psmb9P28076 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Psmb9P28076 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Psmb9P28076 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Psmb9P28076 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Psmb9P28076 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Psmb9P28076 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Psmb9P28076 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Psmb9P28076 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Psmb9P28076 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Psmb9P28076 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Psmb9P28076 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Psmb9P28076 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Psmb9P28076 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Psmb9P28076 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Psmb9P28076 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Psmb9P28076 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Psmb9P28076 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Psmb9P28076 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Psmb9P28076 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Psmb9P28076 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Psmb9P28076 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Psmb9P28076 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Psmb9P28076 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Psmb9P28076 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Psmb9P28076 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Psmb9P28076 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Psmb9P28076 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Psmb9P28076 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Psmb9P28076 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Psmb9P28076 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Psmb9P28076 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms