Protein–RNA interactions for Protein: P28033

Cebpb, CCAAT/enhancer-binding protein beta, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CebpbP28033 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CebpbP28033 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CebpbP28033 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CebpbP28033 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CebpbP28033 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CebpbP28033 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CebpbP28033 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CebpbP28033 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CebpbP28033 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CebpbP28033 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CebpbP28033 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CebpbP28033 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CebpbP28033 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CebpbP28033 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CebpbP28033 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CebpbP28033 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CebpbP28033 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CebpbP28033 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CebpbP28033 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CebpbP28033 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CebpbP28033 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CebpbP28033 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CebpbP28033 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CebpbP28033 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CebpbP28033 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CebpbP28033 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CebpbP28033 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CebpbP28033 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CebpbP28033 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CebpbP28033 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CebpbP28033 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CebpbP28033 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CebpbP28033 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CebpbP28033 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CebpbP28033 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CebpbP28033 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CebpbP28033 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CebpbP28033 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CebpbP28033 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CebpbP28033 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CebpbP28033 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CebpbP28033 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CebpbP28033 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CebpbP28033 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CebpbP28033 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CebpbP28033 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CebpbP28033 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CebpbP28033 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CebpbP28033 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CebpbP28033 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CebpbP28033 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CebpbP28033 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CebpbP28033 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CebpbP28033 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CebpbP28033 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CebpbP28033 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CebpbP28033 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CebpbP28033 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CebpbP28033 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CebpbP28033 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CebpbP28033 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CebpbP28033 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CebpbP28033 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CebpbP28033 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CebpbP28033 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CebpbP28033 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CebpbP28033 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CebpbP28033 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CebpbP28033 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CebpbP28033 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CebpbP28033 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CebpbP28033 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CebpbP28033 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CebpbP28033 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CebpbP28033 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CebpbP28033 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CebpbP28033 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CebpbP28033 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CebpbP28033 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CebpbP28033 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CebpbP28033 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CebpbP28033 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CebpbP28033 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CebpbP28033 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CebpbP28033 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CebpbP28033 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CebpbP28033 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CebpbP28033 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CebpbP28033 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CebpbP28033 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CebpbP28033 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CebpbP28033 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CebpbP28033 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CebpbP28033 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CebpbP28033 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CebpbP28033 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CebpbP28033 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CebpbP28033 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CebpbP28033 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CebpbP28033 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms