Protein–RNA interactions for Protein: P26361

Cftr, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CftrP26361 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CftrP26361 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CftrP26361 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CftrP26361 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CftrP26361 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CftrP26361 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CftrP26361 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CftrP26361 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CftrP26361 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CftrP26361 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CftrP26361 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CftrP26361 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CftrP26361 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CftrP26361 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CftrP26361 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CftrP26361 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CftrP26361 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CftrP26361 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CftrP26361 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CftrP26361 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CftrP26361 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CftrP26361 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CftrP26361 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CftrP26361 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CftrP26361 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CftrP26361 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CftrP26361 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CftrP26361 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CftrP26361 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CftrP26361 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CftrP26361 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CftrP26361 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
CftrP26361 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CftrP26361 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CftrP26361 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CftrP26361 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CftrP26361 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CftrP26361 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CftrP26361 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CftrP26361 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CftrP26361 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CftrP26361 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CftrP26361 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CftrP26361 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CftrP26361 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CftrP26361 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CftrP26361 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CftrP26361 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CftrP26361 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CftrP26361 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CftrP26361 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CftrP26361 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CftrP26361 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CftrP26361 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CftrP26361 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CftrP26361 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CftrP26361 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CftrP26361 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CftrP26361 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CftrP26361 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CftrP26361 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CftrP26361 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CftrP26361 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CftrP26361 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CftrP26361 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CftrP26361 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CftrP26361 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CftrP26361 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CftrP26361 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CftrP26361 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CftrP26361 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CftrP26361 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CftrP26361 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CftrP26361 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CftrP26361 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CftrP26361 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CftrP26361 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CftrP26361 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CftrP26361 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CftrP26361 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CftrP26361 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CftrP26361 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CftrP26361 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CftrP26361 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CftrP26361 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CftrP26361 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CftrP26361 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CftrP26361 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CftrP26361 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CftrP26361 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CftrP26361 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CftrP26361 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CftrP26361 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CftrP26361 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CftrP26361 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CftrP26361 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CftrP26361 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CftrP26361 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CftrP26361 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CftrP26361 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms