Protein–RNA interactions for Protein: P23440

Pde6b, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit beta, mousemouse

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Length 856 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6bP23440 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pde6bP23440 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pde6bP23440 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pde6bP23440 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pde6bP23440 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pde6bP23440 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pde6bP23440 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pde6bP23440 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pde6bP23440 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pde6bP23440 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pde6bP23440 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pde6bP23440 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pde6bP23440 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Pde6bP23440 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Pde6bP23440 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pde6bP23440 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pde6bP23440 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Pde6bP23440 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pde6bP23440 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Pde6bP23440 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pde6bP23440 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Pde6bP23440 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pde6bP23440 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Pde6bP23440 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pde6bP23440 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pde6bP23440 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pde6bP23440 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pde6bP23440 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pde6bP23440 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pde6bP23440 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pde6bP23440 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pde6bP23440 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pde6bP23440 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pde6bP23440 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pde6bP23440 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pde6bP23440 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pde6bP23440 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pde6bP23440 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pde6bP23440 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pde6bP23440 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pde6bP23440 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pde6bP23440 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pde6bP23440 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pde6bP23440 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pde6bP23440 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pde6bP23440 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pde6bP23440 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
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Pde6bP23440 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pde6bP23440 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pde6bP23440 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pde6bP23440 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pde6bP23440 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pde6bP23440 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pde6bP23440 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pde6bP23440 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pde6bP23440 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pde6bP23440 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pde6bP23440 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Pde6bP23440 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pde6bP23440 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pde6bP23440 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pde6bP23440 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pde6bP23440 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pde6bP23440 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pde6bP23440 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pde6bP23440 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pde6bP23440 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pde6bP23440 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pde6bP23440 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pde6bP23440 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Pde6bP23440 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pde6bP23440 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pde6bP23440 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pde6bP23440 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pde6bP23440 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pde6bP23440 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pde6bP23440 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pde6bP23440 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pde6bP23440 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pde6bP23440 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
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Pde6bP23440 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Pde6bP23440 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pde6bP23440 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pde6bP23440 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Pde6bP23440 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pde6bP23440 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pde6bP23440 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pde6bP23440 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pde6bP23440 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pde6bP23440 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pde6bP23440 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pde6bP23440 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pde6bP23440 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pde6bP23440 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pde6bP23440 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pde6bP23440 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pde6bP23440 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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