Protein–RNA interactions for Protein: P22227

Zfp42, Zinc finger protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp42P22227 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp42P22227 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp42P22227 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp42P22227 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp42P22227 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp42P22227 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp42P22227 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp42P22227 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp42P22227 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp42P22227 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp42P22227 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp42P22227 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp42P22227 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp42P22227 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp42P22227 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp42P22227 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp42P22227 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp42P22227 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp42P22227 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp42P22227 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp42P22227 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp42P22227 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp42P22227 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp42P22227 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp42P22227 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp42P22227 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp42P22227 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp42P22227 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp42P22227 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp42P22227 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp42P22227 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp42P22227 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp42P22227 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp42P22227 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp42P22227 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp42P22227 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp42P22227 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp42P22227 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp42P22227 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp42P22227 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp42P22227 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp42P22227 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp42P22227 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp42P22227 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp42P22227 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp42P22227 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp42P22227 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp42P22227 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp42P22227 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp42P22227 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp42P22227 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp42P22227 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp42P22227 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp42P22227 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp42P22227 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp42P22227 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp42P22227 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp42P22227 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp42P22227 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp42P22227 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp42P22227 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp42P22227 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp42P22227 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp42P22227 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp42P22227 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp42P22227 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp42P22227 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp42P22227 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp42P22227 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp42P22227 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp42P22227 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp42P22227 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp42P22227 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp42P22227 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp42P22227 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp42P22227 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp42P22227 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp42P22227 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp42P22227 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp42P22227 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp42P22227 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp42P22227 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp42P22227 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp42P22227 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp42P22227 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp42P22227 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp42P22227 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp42P22227 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp42P22227 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp42P22227 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp42P22227 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp42P22227 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp42P22227 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp42P22227 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp42P22227 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp42P22227 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp42P22227 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp42P22227 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp42P22227 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp42P22227 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms