Protein–RNA interactions for Protein: P20263

Pou5f1, POU domain, class 5, transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou5f1P20263 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pou5f1P20263 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pou5f1P20263 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pou5f1P20263 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pou5f1P20263 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Pou5f1P20263 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pou5f1P20263 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pou5f1P20263 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pou5f1P20263 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pou5f1P20263 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pou5f1P20263 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Pou5f1P20263 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pou5f1P20263 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pou5f1P20263 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pou5f1P20263 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pou5f1P20263 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pou5f1P20263 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pou5f1P20263 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pou5f1P20263 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pou5f1P20263 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pou5f1P20263 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pou5f1P20263 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pou5f1P20263 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pou5f1P20263 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pou5f1P20263 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pou5f1P20263 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pou5f1P20263 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pou5f1P20263 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pou5f1P20263 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pou5f1P20263 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pou5f1P20263 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pou5f1P20263 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pou5f1P20263 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pou5f1P20263 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pou5f1P20263 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pou5f1P20263 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pou5f1P20263 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pou5f1P20263 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pou5f1P20263 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Pou5f1P20263 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pou5f1P20263 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pou5f1P20263 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Pou5f1P20263 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pou5f1P20263 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pou5f1P20263 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pou5f1P20263 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Pou5f1P20263 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Pou5f1P20263 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pou5f1P20263 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pou5f1P20263 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pou5f1P20263 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pou5f1P20263 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pou5f1P20263 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pou5f1P20263 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pou5f1P20263 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pou5f1P20263 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pou5f1P20263 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pou5f1P20263 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pou5f1P20263 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pou5f1P20263 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pou5f1P20263 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pou5f1P20263 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pou5f1P20263 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pou5f1P20263 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pou5f1P20263 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pou5f1P20263 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pou5f1P20263 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pou5f1P20263 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pou5f1P20263 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pou5f1P20263 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pou5f1P20263 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pou5f1P20263 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pou5f1P20263 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pou5f1P20263 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pou5f1P20263 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pou5f1P20263 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pou5f1P20263 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pou5f1P20263 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pou5f1P20263 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pou5f1P20263 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pou5f1P20263 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pou5f1P20263 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pou5f1P20263 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Pou5f1P20263 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pou5f1P20263 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pou5f1P20263 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pou5f1P20263 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pou5f1P20263 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pou5f1P20263 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pou5f1P20263 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pou5f1P20263 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pou5f1P20263 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pou5f1P20263 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pou5f1P20263 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pou5f1P20263 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pou5f1P20263 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pou5f1P20263 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pou5f1P20263 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pou5f1P20263 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pou5f1P20263 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms