Protein–RNA interactions for Protein: P19253

Rpl13a, 60S ribosomal protein L13a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13aP19253 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms