Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NefhP19246 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NefhP19246 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NefhP19246 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NefhP19246 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NefhP19246 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NefhP19246 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NefhP19246 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NefhP19246 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NefhP19246 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NefhP19246 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NefhP19246 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NefhP19246 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NefhP19246 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NefhP19246 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NefhP19246 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NefhP19246 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NefhP19246 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NefhP19246 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NefhP19246 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NefhP19246 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NefhP19246 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NefhP19246 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NefhP19246 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NefhP19246 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NefhP19246 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NefhP19246 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NefhP19246 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NefhP19246 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NefhP19246 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NefhP19246 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NefhP19246 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NefhP19246 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NefhP19246 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NefhP19246 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NefhP19246 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NefhP19246 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NefhP19246 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NefhP19246 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NefhP19246 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NefhP19246 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NefhP19246 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NefhP19246 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NefhP19246 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NefhP19246 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
NefhP19246 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NefhP19246 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NefhP19246 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NefhP19246 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NefhP19246 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NefhP19246 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NefhP19246 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NefhP19246 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NefhP19246 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NefhP19246 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NefhP19246 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NefhP19246 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
NefhP19246 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NefhP19246 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NefhP19246 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NefhP19246 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NefhP19246 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NefhP19246 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NefhP19246 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NefhP19246 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NefhP19246 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NefhP19246 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NefhP19246 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NefhP19246 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NefhP19246 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NefhP19246 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NefhP19246 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
NefhP19246 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
NefhP19246 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NefhP19246 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NefhP19246 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NefhP19246 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NefhP19246 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NefhP19246 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
NefhP19246 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NefhP19246 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NefhP19246 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NefhP19246 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NefhP19246 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NefhP19246 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NefhP19246 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NefhP19246 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NefhP19246 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NefhP19246 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
NefhP19246 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NefhP19246 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NefhP19246 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NefhP19246 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
NefhP19246 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NefhP19246 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NefhP19246 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NefhP19246 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NefhP19246 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NefhP19246 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NefhP19246 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms